Kit Deteksi Asam Nukleat Coronavirus(SARS-Cov-2) Anyar
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Flubijihscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Prodokt name 】Kit Deteksi Asam Nukleat Coronavirus(SARS-Cov-2) Anyar (Metode Probe RT-PCR Fluoresensi)
【Packaging specifications 】25 Tes / Kit
【Intended usumur】
Kit iki digunakake kanggo deteksi kualitatif asam nukleat saka coronavirus anyar ing swab nasopharyngeal, swab oropharyngeal (tenggorokan), swab irung anterior, swab mid-turbinate, cuci irung lan aspirasi irung saka individu sing dicurigai COVID19 dening panyedhiya kesehatan. Deteksi gen ORF1ab lan N saka koronavirus anyar bisa digunakake kanggo diagnosa tambahan lan pemantauan epidemiologis infeksi koronavirus anyar.
【Principles of the procedure 】
Kit iki dirancang kanggo probe TaqMan lan primer khusus sing dirancang kanggo urutan gen ORF1ab lan N coronavirus novel (SARS-Cov-2). Solusi reaksi PCR ngemot 3 set primer spesifik lan probe fluoresensi kanggo deteksi target spesifik, lan set tambahan primer khusus lan probe fluoresensi digunakake minangka kontrol standar internal kit kanggo ndeteksi gen housekeeping endogen.
Prinsip tes yaiku probe neon spesifik dicerna lan dirusak dening aktivitas exonuclease enzim Taq ing reaksi PCR, supaya klompok neon reporter lan klompok neon sing dipateni dipisahake, supaya sistem pemantauan fluoresensi bisa nampa neon. sinyal, lan banjur Liwat efek pengayaan saka amplifikasi PCR, sinyal fluoresensi probe tekan nilai ambang pesawat-Nilai Ct (Batesan siklus). Yen ora ana target amplicon, klompok reporter probe cedhak karo klompok quenching. Ing wektu iki, transfer energi resonansi fluoresensi dumadi, lan fluoresensi klompok reporter dipateni dening grup quenching, supaya sinyal neon ora bisa dideteksi dening instrumen PCR neon.
Kanggo ngawasi panggunaan reagen sajrone tes, kit kasebut dilengkapi kontrol positif lan negatif: kontrol positif ngemot plasmid rekombinan situs target, lan kontrol negatif yaiku banyu suling, sing digunakake kanggo ngawasi polusi lingkungan. Disaranake nyetel kontrol positif lan kontrol negatif bebarengan nalika nyoba.
【Main components 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | Component | |
Name | Specifikasi | Jumlahiki | Jumlahiki | |
Kontrol positif | 180 μL / vial | 1 | 1 | Plasmid sing digawé sacara artifisial, banyu suling |
Kontrol negatif | 180 μL / vial | 1 | 1 | Banyu suling |
Campuran SARS-Cov-2 | 358,5 μL / vial | 1 | / | Pasangan primer spesifik, probe fluoresen deteksi spesifik, dNTP, , MgCl2, KCl, Tris-Hcl, Air suling, lsp |
Campuran enzim | 16,5 μL / vial | 1 | / | Enzim Taq, reverse transcriptase, enzim UNG, lsp. |
Campuran SARS-Cov-2 (Liofil) | 25 tes / vial | / | 1 | Pasangan primer spesifik, probe fluoresen deteksi spesifik, dNTP, enzim Taq, reverse transcriptase, Air suling, lsp. |
2x Buffer | 375 μL / vial | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, banyu suling, lsp. |
Cathetan:(1) Komponen ing kit batch beda ora bisa dicampur utawa diijolake.
(2) Siapke reagen sampeyan dhewe: Kit ekstraksi asam nukleat.
【Storage condikions lan expiration date 】
For BST-SARS-25:Transport lan nyimpen ing -20±5 ℃ kanggo dangu.
For BST-SARS-DR-25:Transportasi ing suhu kamar. Simpen ing -20±5 ℃ kanggo dangu.
Ngindhari siklus beku-thaw bola-bali. Periode validitas disetel kanggo 12 wulan.
Deleng label kanggo tanggal produksi lan panggunaan.
Sawise mbukak pisanan, reagen bisa disimpen ing -20 ± 5 ° C kanggo ora luwih saka 1 sasi utawa nganti pungkasan periode reagen, whichever tanggal rawuh pisanan, supaya bola beku-thaw siklus, lan nomer beku reagen. -siklus thaw ngirim ora ngluwihi 6 kaping.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1. Tipe sampel sing bisa ditrapake: Solusi asam nukleat sing diekstrak.
2.Sample panyimpenan lan transportasi: Simpen ing-20 ± 5 ℃ kanggo 6 months.Freeze lan thaw conto ora luwih saka 6 kaping.
【Testing method】
1.Nucleic acid extraction
Pilih kit ekstraksi asam nukleat sing cocog kanggo ngekstrak asam nukleat virus, lan tindakake pandhuan kit sing cocog. Disaranake nggunakake kit ekstraksi lan pemurnian asam nukleat sing diprodhuksi dening Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. utawa kit pemurnian asam nukleat sing padha.
2. Reaction reagent preparation
2.1 For BST-SARS-25:
(1) Copot Campuran SARS-Cov-2 lan Campuran Enzim, leleh kanthi lengkap ing suhu kamar kanthi piranti Vortex banjur centrifuge sedhela.
(2) Campuran Enzim 16.5uL ditambahake menyang 358.5uL Campuran SARS-Cov-2 lan dicampur kanthi tliti kanggo entuk solusi reaksi campuran.
(3) Siapke tabung oktal PCR 0,2 mL sing resik lan tandhani nganggo 15uL larutan reaksi campuran ing ndhuwur saben sumur.
(4) Tambah 15 μL larutan asam nukleat sing diresiki, kontrol positif lan kontrol negatif, lan tutup tutup tabung octal kanthi ati-ati.
(5) Nyampur kanthi apik kanthi mbalikke mudhun, lan cepet centrifuge kanggo konsentrasi cairan ing ngisor tabung.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
( 1) Tambah 375ul 2x Buffer kanggo SARS-Cov-2 Mix((Lyophilised) kanggo nyiyapake campuran reaksi. Campur sak tenane dening pipetting banjur centrifuge sedhela. (Sawise campuran reaksi disiapake, dianjurake kanggo nyimpen ing -20 ℃ ing panyimpenan jangka panjang.)
(2) Siapke tabung oktal PCR 0,2 mL sing resik lan tandhani karo 15μL campuran reaksi saben sumur.
(3) Tambah 15μL larutan asam nukleat sing diresiki, kontrol positif lan kontrol negatif, lan tutup tutup tabung octal kanthi ati-ati.
(4) Nyampur kanthi apik kanthi mbalikke mudhun, lan cepet centrifuge kanggo konsentrasi cairan ing ngisor tabung.
3. PCR amplification (Mangga deleng manual instrumen kanggo setelan operasi.)
3. 1 Selehake PCR 8-tabung menyang kamar sampel instrumen PCR neon, lan nyetel sampel kanggo dites, kontrol positif lan kontrol negatif miturut urutan loading.
3.2 Saluran deteksi fluoresensi:
(1) gen ORF1ab milih saluran deteksi FAM (Reporter: FAM, Quencher: Ora ana).
(2) N gen milih saluran deteksi VIC (Reporter: VIC, Quencher: Ora ana).
(3) Gen standar internal milih saluran deteksi CY5 (Reporter: CY5, Quencher: Ora ana).
(4) Referensi Pasif disetel menyang ROX.
3.3 Pengaturan parameter program PCR:
Langkah | Suhu (℃) | Wektu | Jumlah siklus | |
1 | Reaksi transkripsi mbalikke | 50 | 15 min | 1 |
2 | Aktivasi enzim Taq | 95 | 2,5 min | 1 |
3 | Aktivasi enzim Taq | 93 | 10 s | 43 |
Extension Annealing lan akuisisi fluoresensi | 55 | 30 s |
Sawise nyetel, simpen file lan mbukak program reaksi.
4.Results analysis
Sawise program rampung, asil disimpen kanthi otomatis, lan kurva amplifikasi dianalisis. Kurva amplifikasi disetel menyang ambang gawan instrumen.
【Explanation of test results 】
1. Nemtokake validitas eksperimen: FAM kontrol positif, saluran VIC kudu duwe kurva amplifikasi khas, lan nilai Ct umume kurang saka 34, nanging bisa fluktuasi amarga setelan batesan beda saka instrumen sing beda. FAM kontrol negatif, saluran VIC kudu non-amplified Ct. Disepakati yen syarat ing ndhuwur kudu ditindakake bebarengan, yen ora, tes iki ora sah.
2. Asil paukuman
Saluran FAM/VIC | Hasil putusan |
Ct<37 | Tes sampel positif |
37≤Ct<40 | Kurva amplifikasi berbentuk S, lan conto sing curiga kudu ditliti maneh; yen asil tes maneh konsisten, dianggep positif, yen ora negatif |
Ct≥40 Utawa Ora Ana Amplifikasi | Tes sampel negatif (utawa ing ngisor watesan deteksi kit) |
Cathetan: ( 1) Yen saluran FAM lan saluran VIC positif ing wektu sing padha, SARS-Cov-2 ditemtokake positif.
(2) Yen saluran FAM utawa saluran VIC positif lan saluran liyane negatif, tes kudu diulang. Yen positif ing wektu sing padha, bakal dianggep positif SARS-Cov-2, yen ora bakal dianggep negatif SARS-Cov-2.